MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 1895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	GC	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020287	AAT	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020287	ATC	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020287	TCA	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020287	AGA	3	9	188	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816675
6	NC_020287	TTA	2	6	243	248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816675
7	NC_020287	TTG	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816675
8	NC_020287	GTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816675
9	NC_020287	T	6	6	371	376	0 %	100 %	0 %	0 %	451816675
10	NC_020287	CTT	3	9	382	390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816675
11	NC_020287	TGA	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816675
12	NC_020287	TCA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816675
13	NC_020287	CA	3	6	481	486	50 %	0 %	0 %	50 %	451816675
14	NC_020287	CCA	2	6	497	502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020287	AT	3	6	599	604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020287	CTT	2	6	613	618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020287	TCC	2	6	666	671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_020287	T	7	7	672	678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020287	CTGTTT	2	12	679	690	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020287	T	6	6	715	720	0 %	100 %	0 %	0 %	451816676
21	NC_020287	CCATC	2	10	761	770	20 %	20 %	0 %	60 %	451816676
22	NC_020287	CCT	2	6	784	789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816676
23	NC_020287	ACT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816676
24	NC_020287	TTTTA	2	10	937	946	20 %	80 %	0 %	0 %	451816676
25	NC_020287	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816676
26	NC_020287	TAT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816676
27	NC_020287	TCTT	2	8	1024	1031	0 %	75 %	0 %	25 %	451816676
28	NC_020287	AT	3	6	1133	1138	50 %	50 %	0 %	0 %	451816676
29	NC_020287	TGT	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816676
30	NC_020287	T	6	6	1168	1173	0 %	100 %	0 %	0 %	451816676
31	NC_020287	TAT	2	6	1192	1197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816676
32	NC_020287	TAT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816676
33	NC_020287	CTTC	2	8	1211	1218	0 %	50 %	0 %	50 %	451816676
34	NC_020287	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816676
35	NC_020287	TCT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816676
36	NC_020287	T	6	6	1248	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	451816676
37	NC_020287	AAC	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020287	ATT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816677
39	NC_020287	CAAA	2	8	1426	1433	75 %	0 %	0 %	25 %	451816677
40	NC_020287	GGC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816677
41	NC_020287	CTC	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816677
42	NC_020287	TTG	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816677
43	NC_020287	CGC	2	6	1682	1687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816677
44	NC_020287	A	6	6	1735	1740	100 %	0 %	0 %	0 %	451816677
45	NC_020287	TAA	2	6	1785	1790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816677
46	NC_020287	ATCA	2	8	1798	1805	50 %	25 %	0 %	25 %	451816677
47	NC_020287	CCCG	2	8	1968	1975	0 %	0 %	25 %	75 %	451816678
48	NC_020287	CCA	3	9	1987	1995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816678
49	NC_020287	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816678
50	NC_020287	AATTA	2	10	2018	2027	60 %	40 %	0 %	0 %	451816678
51	NC_020287	CTTGGT	2	12	2059	2070	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020287	TGCC	2	8	2109	2116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020287	CAA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020287	AAAAT	2	10	2145	2154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020287	CAT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020287	TGG	2	6	2267	2272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020287	AAT	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020287	AAT	2	6	2308	2313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020287	A	6	6	2337	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020287	TGAA	2	8	2396	2403	50 %	25 %	25 %	0 %	451816679
61	NC_020287	GGCA	2	8	2418	2425	25 %	0 %	50 %	25 %	451816679
62	NC_020287	CCTGG	2	10	2545	2554	0 %	20 %	40 %	40 %	451816679
63	NC_020287	CAC	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816679
64	NC_020287	A	6	6	2592	2597	100 %	0 %	0 %	0 %	451816679
65	NC_020287	TGA	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816679
66	NC_020287	CAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816679
67	NC_020287	GCC	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816679
68	NC_020287	G	6	6	2790	2795	0 %	0 %	100 %	0 %	451816679
69	NC_020287	CCG	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816679
70	NC_020287	GAT	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816679
71	NC_020287	CAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816679
72	NC_020287	TAT	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020287	T	6	6	3058	3063	0 %	100 %	0 %	0 %	451816680
74	NC_020287	CTA	2	6	3109	3114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816680
75	NC_020287	TTC	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816680
76	NC_020287	TCT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816680
77	NC_020287	AAG	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816680
78	NC_020287	TGT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816680
79	NC_020287	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	451816680
80	NC_020287	TGA	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816680
81	NC_020287	TTG	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816680
82	NC_020287	ATT	3	9	3370	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816681
83	NC_020287	CGC	2	6	3472	3477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816681
84	NC_020287	ATC	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816681
85	NC_020287	GCC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816681
86	NC_020287	TTG	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816681
87	NC_020287	TAG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816681
88	NC_020287	AAT	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020287	CCT	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_020287	CCA	2	6	3800	3805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_020287	TTC	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020287	CAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020287	TC	3	6	3890	3895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020287	AAC	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020287	ATC	2	6	4020	4025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020287	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020287	AAT	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020287	A	7	7	4183	4189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020287	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020287	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816682
101	NC_020287	TATC	2	8	4274	4281	25 %	50 %	0 %	25 %	451816682
102	NC_020287	GAG	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816682
103	NC_020287	GAG	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816682
104	NC_020287	AT	3	6	4419	4424	50 %	50 %	0 %	0 %	451816682
105	NC_020287	GCAA	2	8	4439	4446	50 %	0 %	25 %	25 %	451816682
106	NC_020287	A	7	7	4445	4451	100 %	0 %	0 %	0 %	451816682
107	NC_020287	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816682
108	NC_020287	A	6	6	4489	4494	100 %	0 %	0 %	0 %	451816682
109	NC_020287	AGGA	2	8	4508	4515	50 %	0 %	50 %	0 %	451816682
110	NC_020287	TCA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816682
111	NC_020287	G	6	6	4648	4653	0 %	0 %	100 %	0 %	451816682
112	NC_020287	ATA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816682
113	NC_020287	AGA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816682
114	NC_020287	AAT	2	6	4820	4825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816682
115	NC_020287	AG	3	6	4885	4890	50 %	0 %	50 %	0 %	451816682
116	NC_020287	TGA	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816682
117	NC_020287	A	6	6	4983	4988	100 %	0 %	0 %	0 %	451816682
118	NC_020287	A	7	7	5003	5009	100 %	0 %	0 %	0 %	451816682
119	NC_020287	AAG	2	6	5154	5159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816682
120	NC_020287	ACA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816682
121	NC_020287	TG	3	6	5205	5210	0 %	50 %	50 %	0 %	451816682
122	NC_020287	A	6	6	5211	5216	100 %	0 %	0 %	0 %	451816682
123	NC_020287	TGA	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816682
124	NC_020287	TTTGC	2	10	5262	5271	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020287	ATT	2	6	5278	5283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020287	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816683
127	NC_020287	CTC	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816683
128	NC_020287	GAG	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816683
129	NC_020287	TTTCAA	2	12	5474	5485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451816683
130	NC_020287	ATTA	2	8	5508	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	451816683
131	NC_020287	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816683
132	NC_020287	G	6	6	5890	5895	0 %	0 %	100 %	0 %	451816683
133	NC_020287	TTG	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816683
134	NC_020287	TAAA	2	8	6006	6013	75 %	25 %	0 %	0 %	451816683
135	NC_020287	GA	3	6	6034	6039	50 %	0 %	50 %	0 %	451816683
136	NC_020287	CTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816683
137	NC_020287	CAT	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816683
138	NC_020287	CAAA	2	8	6294	6301	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020287	TAT	2	6	6302	6307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020287	CT	3	6	6392	6397	0 %	50 %	0 %	50 %	451816684
141	NC_020287	ACC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816684
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401	NC_020287	ATC	2	6	19885	19890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_020287	T	6	6	19966	19971	0 %	100 %	0 %	0 %	451816695
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405	NC_020287	GAA	2	6	20082	20087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816695
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